وزارت ترانسپورت یکی از وزارتخانه‌های افغانستان است که وظیفهٔ تنظیم ترانسپورت هوایی و زمینی، عملیات در میدان‌های هوایی، خطوط بین‌المللی و سایر تصدی‌های دولتی را در معاملات ترانسپورتی ذیدخل بر عهده دارد. در سال ۱۳۹۷خ، به فرمان رئیس‌جمهور افغانستان محمد اشرف غنی با وزارت فوائد عامه، ادارات هوانوردی ملکی، خط‌آهن و ریاست ترافیک وزارت امور داخله ادغام و وزارت ترانسپورت ایجاد شد.